吗替麦考酚酯口服后可迅速吸收并水解为麦考酚酸(MPA),MPA 是强效的、选择性的、竞争性和可逆性的次黄嘌岭单核苷酸脱氢酯(IMPDH)抑制剂,能够抑制鸟嘌呤核苷的从头合成途径使之不能形成 DNA,因为 T 和 B 淋巴绘胞的增殖严格依赖于嘌呤的从头合成,而其它的细胞可以利用补救途径,因此 MPA 有抑制淋巴细胞增殖的作用,MPA 可以判制有丝分裂原和同种特异性刺激物引起的 T 和 B 淋巴细胞增殖,MPA 还可以抑制 B 淋巴细胞产生抗体,MPA 可以抑制淋巴细胞和单核细胞糖蛋白的糖基化,而糖蛋白的糖基化是细胞与内皮细胞粘附相关的,因此可以抑制白细胞进入炎症和移植物排斥反应的部位。
吗替麦考酚酯不能抑制外周血单核细胞活化的早期反应,如白介素-1 和白介素-2 的产生等,但可以抑制这些早期反应所导致的 DNA 合成和增殖反应。